大约有76%的患者有胃运动功能障碍，即“糖尿病性胃轻瘫”，其病理生理特点是胃肠张力和收缩力下降，蠕动减慢，排空延迟，患者主要表现为腹胀、上腹不适感、早饱、恶心和呕吐等症状。
糖尿病伴发小肠、结肠和肛门运动功能障碍的患者也十分常见，患者常常表现为慢性便秘、腹泻或大便失禁。腹泻和便秘分别见于22％和60％的糖尿病患者。糖尿病性腹泻常为顽固性、间歇性腹泻，棕黄色水样便，量较多，偶可伴有里急后重。腹泻可发生于任何时间，以夜间及清晨多见，每日少者3～5次，多者可达20～30次。有些患者伴有大便失禁或腹泻与便秘交替出现，间歇期排便可正常。糖尿病性便秘也表现为间歇性。
虽然有些口服降糖药如双胍类(二甲双胍等)、α—糖苷酶抑制剂(拜唐苹、卡博平)也可引起胃肠反应，但研究表明2型糖尿病患者常见的胃肠道症状中只有腹泻和便失禁与之有关，其他并非由口服降糖药引起，说明不能用口服降糖药物解释糖尿病患者的胃肠道症状。
