葡萄糖氧化酶对葡萄糖特异性高，由于反应过程需要氧的参与，试纸也易与空气中的氧气发生反应，所以操作需按规程。
葡萄糖脱氢酶反应过程需要一定的辅酶和介质的参与，有些辅基可能与注射用麦芽糖、口服木糖和半乳糖发生反应，造成结果假性升高。患者需要最大限度避免这些物质，使血糖检测的数据更加精准。
此外，糖尿病患者在一些特殊的情况下，对缺氧的人群，如心衰、严重感染和在高原的患者使用基于葡萄糖氧化酶原理的血糖仪，可能会出现检测误差。
而如果接受含麦芽糖药物治疗的和接受大量丙种球蛋白治疗的患者使用基于葡萄糖脱氢酶原理的血糖仪，也可能会出现检测误差。
